Abatus Microsatellites data set 2009/13

データ レコード

この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、249 レコードが含まれています。

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バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Carrea, C., Burridge, C., King, C.K., Miller, K. (2016, updated 2018) Abatus Microsatellites data set Australian Antarctic Data Centre -

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Australian Antarctic Data Centre。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 852fd378-2356-4b27-be1b-e7c05aa3ed36が割り当てられています。   Atlas of Living Australia によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているAustralian Antarctic Data Centre が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence; EARTH SCIENCE; BIOLOGICAL CLASSIFICATION; ANIMALS/INVERTEBRATES; ECHINODERMS; SEA URCHINS

連絡先

地理的範囲

Sea urchin individuals were collected in five sites separated by up to 5 km in the near-shore area surrounding Davis Station in the Vestfold Hills Region, East Antarctica.

生物分類学的範囲

Main goal was to study and compare the fine-scale population structure and demographic history of three species of Antarctic sea urchins (Abatus ingens, Abatus shackletoni and Abatus philippii) in the near-shore area surrounding the Australian Reseach Sation Davis in East Antarctica. A secondary goal was to test potential impacts of pollution from the Davis Station wastewater discharge on the genetic diversity and effective population size of these species

時間的範囲

プロジェクトデータ

The present data set corresponds to the genotypes for seven microsatellite markers for three Antarctic sea urchin species of the genus Abatus. Sea urchin individuals were collected in five sites separated by up to 5 km in the near-shore area surrounding Davis Station in the Vestfold Hills Region, East Antarctica. For each microsatellite loci, the size of each allele was scored (in base pairs) using the CEQ 8000 Genetic Analysis System software v.8.0. Fragments were separated on an automated sequencer (CEQ 8000, Beckman Coulter) in the Central Science Laboratory at University of Tasmania.

プロジェクトに携わる要員:

収集方法

Samples were collected from 5 sites, and the largest distance between any 2 sampling sites was 5 km. Three of the sites are considered heavily impacted: OF (outfall), OF1 and OF2 are within 500 m of the outfall pipe. The 2 control sites are considered to have negligible impact from the wastewater discharge; OF3 is located ~2.4 km from the outfall pipe to the northeast, and OF4 ~2.6 km to the southwest. Moreover, the OF3 and OF4 sites are both removed from the predominant longshore flow that transports the wastewater plume southeastwards along the coast (Stark et al. unpubli.). Samples from OF1 and OF2 were collected at 4.5− 7.0 m and 10−12 m depths, respectively, during the 2009/2010 Antarctic field season, and samples from OF, OF3 and OF4 were taken at depths <4 m during the 2012/2013 season.

Method step description:

1. For each microsatellite loci, the size of each allele was scored (in base pairs) using the CEQ 8000 Genetic Analysis System software v.8.0. Fragments were separated on an automated sequencer (CEQ 8000, Beckman Coulter) in the Central Science Laboratory at University of Tasmania.

書誌情報の引用

1. Cecilia Carrea, Christopher P. Burridge, Catherine K. King, Karen J. Miller (2016) Population structure and long-term decline in three species of heart urchins Abatus spp. near-shore in the Vestfold Hills region, East Antarctica. Marine Ecology Progress Series, 545:227-238 doi: 10.3354/meps11573

追加のメタデータ